耳廓畸形可采用手术方法进行治疗，手术年龄要根据不同情况来确定，如单纯的副耳或多耳切除，应在学龄前手术，以免上学后同学们的议论对孩子造成心理创伤，不利于孩子身心健康。若是双侧小耳或无耳，伴有外耳道及中耳畸形、听力障碍者，也宜在学龄前手术;此时整形手术不止是矫治耳廓畸形，同时要提高听力，如重建外耳道和处理中耳畸形，做鼓室成形。这样，一方面有利于儿童上学后的学习，更重要的是有利于语言发育。如果是一侧小耳畸形，另一耳听力正常者，或双耳廓畸形，有一耳或双耳听力正常者，手术可以推迟到15岁以后。因为那时手术患者能配合，加上其耳廓发育完全，医生可以设计出大小合适的耳廓，而学龄前手术其耳廓大小一般只能以患儿父母的耳廓作模型进行重建和成形。
耳廓畸形的手术治疗，主要有耳廓重建、附耳切除及招风耳的矫正。
耳廓重建有着悠久的历史，耳廓重建往往需要某种材料作支架，以保证重建耳廓的外形。有的医生选用患者自体肋软骨，也有人使用硅胶块来重建。自体肋软骨因为是病人自身组织，无抗原性，容易塑形，术后一般无并发症。但因在胸壁上切口取软骨，创伤相对较大，术后局部疼痛，痛苦相对大些。硅胶块来源比较容易，亦易塑形，不需要另作切口。但硅胶作为一种异物置入组织常常引起一些不良反应，如伤口感染、切口不愈、支架裸露招致手术失败，所以多数医生采用病人自身软骨作耳廓支架。但由于耳部很薄，且形状复杂，再造的耳朵一般很难达到完美的形态。
耳前长了小肉赘，医学上称为附耳，是一种先天性发育畸形，可以用外科手术方法切除。此手术一般出血不多，伤口疤痕不明显，手术后也很少复发。切除后对面容美观有改善。这种手术由口腔颌面外科施行。
招风耳是常见的先天性外耳畸形，一般为双侧性，但左右两侧不一定完全对称。正常耳廓与头颅侧面约成30o角，从后面看时，耳甲与头颅约成90o角，耳甲与耳舟亦成90o角。如果是招风耳，耳甲与头颅大致为90o角，但耳甲与耳舟之间的角度则大大增加，或完全成180o。因此，耸立在头颅上，严重地影响了面部的美观。矫正招风耳，首先要在耳后作纵形切口，以暴露出耳软骨，并在软骨上作两条弧形切口，然后把两侧软骨缘缝合，就会在耳外侧面形成耳廓的形态，再切除耳甲的部分软骨，最后在耳后切除多余部分的皮肤。
